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Imagerie numérique en biologie : outils et méthodes

Résumé

Type de certification

  • Formation qualifiante

Thématique

  • Histologie

Composante(s)

Présentation

Code FC

  • B143

Objectifs

  • Posséder les bases théoriques du traitement et de l'analyse d'images en biologie.
  • Savoir élaborer et mettre en œuvre une chaîne de traitement et d’analyse d’images.
  • Maîtriser l’essentiel d’un outil de traitement et d’analyse d’images.

Contenu

  • Images numériques, types d'images et formats de fichiers.
  • Traitement d'images : transformations d’histogramme et filtrage.
  • Transformée de Fourier.
  • Segmentation et morphologie mathématique.
  • Analyse quantitative des images.
  • Introduction à l'imagerie 3D.
  • Introduction à l'écriture de macros sous ImageJ.

La formation alterne cours théoriques et séances pratiques sur ordinateur. Les séances pratiques sont réalisées avec le logiciel libre multi-plateforme ImageJ/Fiji. Un après-midi est réservé à des analyses de cas à partir des images fournies par les participants.

Effectif minimal

  • 1

Effectif maximal

  • 4

Public cible et prérequis

Public et prérequis

Techniciens, ingénieurs et chercheurs intéressés par le traitement et l'analyse d'images, désirant en connaître les bases théoriques et maîtriser les outils disponibles.

Aucune connaissance particulière en informatique n'est requise, seule une pratique habituelle de l'ordinateur est souhaitable

Tarifs

Tarifs

1 200 €

840 € dans le cadre du module organisé pour l’école doctorale.

Organisation/Calendrier

Organisation

Nombre de participants :

La formation est organisée pour un groupe d'étudiants doctorants dans lequel on peut accueillir 4 stagiaires maximum.

Calendrier

du 13 au 17 mars 2017

+ Possibilité de session sur demande.

 

Durée

  • Une semaine (35h).

Lieu(x)

  • Campus Jussieu

Contacts/Inscription

Responsable

  • Andrey Philippe

Inscription

Contact administratif

Pôle sciences - Corinne Vidal – 01 44 27 82 82
email : formation.continue @ upmc.fr
Accueil public : campus Jussieu – 4, place Jussieu – 75005 Paris – Tour 14/24 – 5e étage

Evaluation/Validation

Validation

  • Attestation de fin de formation